Abbatini étudia à Rome et occupa brièvement une succession de postes de maestro di cappella au Seminario Romano, à San Giovanni in Laterano, au Gesù, à Sainte-Marie-Majeure et à San Luigi dei Francesi.

Dans les années 1640, il participa à une nouvelle édition d'hymnes grégoriens et aida Athanasius Kircher à rassembler le monumental traité Musurgia universalis, paru en 1650.

Abbatini publia au moins six livres de canzones sacrées ainsi qu'une messe à 16 voix et de nombreux motets. Il composa aussi des cantates et des opéras, et fournit les récitatifs secco et les finales à ensembles - parmi les premiers du genre - des actes I et III de l'opéra-comique de Marco Marazzoli Dal maie il bene, représenté au palazzo Barberini en 1653.

Grâce à l'influence de Cesti à la cour des Habsbourg, Ione d'Abbatini put être donné au Hoftheater de Vienne en 1664. La comica del cielo fut représenté au palazzo Rospigliosi de Rome quatre ans plus tard.